Đài Loan, một quốc gia đánh bắt cá lớn và là nhà sản xuất hải sản nuôi trồng quy mô lớn, sẽ bị ảnh hưởng nghiêm trọng đến mức thủ tướng Đài Loan Cho Jung-tai cho biết vào thứ Hai (ngày 7 tháng 4) rằng chính phủ đang tìm cách hỗ trợ ngành này,  đưa tin. Theo Bộ Nông nghiệp Đài Loan, Đài Loan đã xuất khẩu 16.859 tấn cá rô phi đông lạnh vào năm 2024, trong đó 13.257 tấn được xuất khẩu sang Hoa Kỳ, tổng giá trị hơn 40 triệu USD. Đài Loan cũng đã xuất khẩu 4.618 tấn cá mú đông lạnh trị giá 6,52 triệu USD vào năm 2024, trong đó 1.197 tấn được xuất khẩu sang Hoa Kỳ. Tổng giám đốc điều hành Hiệp hội phát triển nuôi trồng thủy sản Đài Loan Hou Yen-lung cho biết để ứng phó với mức thuế quan, các nhà xuất khẩu Đài Loan có thể sẽ chuyển hướng sang Úc, nơi đã nhập khẩu hơn 1.200 tấn cá rô phi và 3.000 tấn cá vược từ Đài Loan vào năm 2024. Hou cho biết trong số các đối thủ cạnh tranh chính của Đài Loan trên thị trường cá rô phi – Thái Lan, Trung Quốc, Việt Nam, Indonesia và Brazil – chỉ có Brazil, quốc gia nhận được mức thuế tương đối thấp là 10%, giành được lợi thế cạnh tranh từ mức thuế của Trump, mặc dù Hou cho biết tổ chức của ông vẫn đang nghiên cứu những tác động dự kiến ​​và hậu quả của chúng. Về mặt đánh bắt tự nhiên, Đài Loan đã xuất khẩu 2.675 tấn cá kiếm trị giá 10,7 triệu USD vào năm ngoái, trong đó khoảng một nửa được xuất khẩu sang Hoa Kỳ. Phó giám đốc Cơ quan Thủy sản Đài Loan Trần Kiến Vũ cho biết chính phủ đang xây dựng kế hoạch chuyển hướng xuất khẩu của Hoa Kỳ sang các thị trường khác, bao gồm thị trường nội địa, và chính phủ Đài Loan sẽ trợ cấp và cho ngư dân địa phương vay để bù đắp thiệt hại do thuế quan gây ra.